Приложение для DreamShell

[SWAT]

А ты про это. Ну да, root директория DS берется из getenv("PATH"), а относительно нее уже идет в apps/cmds.
Но вообще приложения регистрируются на старте ядра в startup.lua и потом уже ты можешь оперировать ими получив уже готовый список с помощью функции GetAppList.
Так что тебе нет необходимости самому за ними ходить куда то, они уже все в системе зарегистрированы.

То что происходит с путями в Main приложении (в функции BuildAppList) это по большей части для скриптов на рабочем столе, а не для самих приложений. Список приложений там берется как раз с помощью GetAppList.